[Артем Enot Грунин]

Мне кажется, логичным решением будет воспользоваться стандартный мастер импорт. Заставлять их сохранять в другом формате - не недоработка, а ограничение системы. Шаблон, действительно, может быть в любом формате. Проблемой могут стать лишь кодировки, так как Excel до сих пор не научился работать с юникодом.
Дубликаты - тоже не проблема. В 4.0 вы можете настроить "Правила поиска дубликатов", и они будут работать в том числе и при импорте. Правда в том случае, если, пользователь указал эту опцию. Если нет - тоже не страшно. Интерес - лишь потенциальный клиент. База интересов часто оказывается замусорена.