Вопрос в том, как настроены проводки и какой план счетов. Налоговый учет доходов и расходов для налогообложения налогом на прибыль (собственно налоговый учет) никакого отношения к декларации не имеет, имхо. Те поля декларации, которые 1с декларирует, что они заполняются автоматически, основаны на информации со счетов ГК. Собственно это можно получить и в Axapta. Те поля, которые 1с не может автоматически заполнить, также автоматически не могут быть заполнены в Axapta, SAP и любой другой системе.
Разве что специально, ручками класть информацию в ГК, которая потом торжественно будет попадать в декларацию.
То есть сидит целый цех операторов и долбасит проводки, а главбух торжественно нажимает в определенный момент кнопку и, оп-па, вот она заветная бумага или даже электронный файл.
Это не автоматизация, а механизация.